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Welcome to the Matrix

Each cell in the matrix shows the number of correspondences (and maps) between each pair. A correspondence is any relationship between two features.

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Reference Set Genetic Physical Reference Set
Banana Cassava Citrus Cocoa Coconut Coffee Cupuaçu Sorghum Cotton Oil palm Rubber Tree Sugarcane Banana Cocoa Coconut Coffee Rice Cotton
  Borli Borneo_3 Plilin_3 AF_PAHANG M53 AFCAM White_Fly K_Family_femelle K_Family_male GBS_Soto_et_al_2015 Female_clementine_genetic_map Male_clementine_genetic_map Pink_pummelo_genetic_map Reference_clementine_genetic_map Sweet_orange_genetic_map Synthesis_citrus_genetic_map Chandler_pummelo_genetic_map (Sca6xH)xC1 DR1xCatongo IMC78xCatongo S52xCatongo TSH516 ref_UPA402xUF676 consensus_disease_res Test SSR_SNP_consensus_map F2(Sca-6 x ICS1) RIT2 High_density_genetic_map COFFEE_Ccan_888x02183 Theobroma_grandiflorum_parent-1074 Theobroma_grandiflorum_parent-174 Theobroma_grandiflorum_consensus Crasta1999 HaussmRIP1 HaussmRIP2 Kebede2001 RIL249_Ramietal1998 RIL379_Ramietal1998 Sanchez2002 Tao2000 Xu2000 Guazuncho2xVH8-BC2 Guazuncho2xVH8-BC1 Guazuncho2xVH8-RIL PK CH E3 GVc HDC T3 TH LM2TxDA10D_HD PB260xRO38_male_map_Lespinasse_1999 PB260xRO38_female_map_Lespinasse_1999 PB260xRO38_synthetic_map_Lespinasse_1999 RUBBERTREE_PB260xMDF180_male_map_Le_Guen_2011 Genetic_mapping_of_a_rubber_tree_biparental_population R570AF_Asnaghi_2000 MQ7653_Raboin_2006 R570AF_Grivet_1996 R570AF_Hoarau_2001 R570AF_Rossi_2003 R570_Raboin_2006 physical_map AF-PKW Theobroma_cacao_Physical_map High_density_physical_map COFFEE_CoffeaSeqGenomeV1_DH200 Synthetic_map1 Graimondii_physical  
Genetic Sugarcane
R570_Raboin_2006
group1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 1(1) 4(3) 1(1) - - - - - - - group1 Sugarcane
R570_Raboin_2006
Genetic
group106 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 13(13) - 14(1) 14(1) 1(1) - - - - - - - group106
group107 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group107
group108 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6(6) - 7(1) 7(2) 1(1) - - - - - - - group108
group109 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group109
group11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5(5) - 6(1) 6(1) - - - - - - - - group11
group110 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group110
group111 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 4(2) 4(2) - - - - - - - - group111
group112 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 3(1) 3(1) - - - - - - - - group112
group113 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6(1) 6(1) - - - - - - - - group113
group114 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5(5) - 5(1) 9(5) 2(2) - - - - - - - group114
group115 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group115
group12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 14(11) - 7(1) 10(5) 7(7) - - - - - - - group12
group124 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group124
group125 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group125
group126 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 6(1) 6(1) - - - - - - - - group126
group127 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - group127
group128 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 7(1) 7(1) - - - - - - - - group128
group129 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group129
group130 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - - - - - - - - - - - group130
group137 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 3(1) 3(1) - - - - - - - - group137
group143 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group143
group144 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group144
group145 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group145
group146 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 5(1) 6(2) - - - - - - - - group146
group148 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6(6) - 2(1) 5(3) 3(3) - - - - - - - group148
group149 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group149
group153 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - group153
group154 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 3(1) 5(3) 1(1) - - - - - - - group154
group155 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - - 4(4) 1(1) - - - - - - - group155
group156 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 4(1) 4(1) - - - - - - - - group156
group16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group16
group160 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 3(1) 3(1) - - - - - - - - group160
group164 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group164
group165 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - - 3(3) 2(2) - - - - - - - group165
group166 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 3(1) 3(1) - - - - - - - - group166
group169 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group169
group171 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group171
group172 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 2(1) 4(2) 2(2) - - - - - - - group172
group173 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group173
group175 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 9(7) - - 3(3) 5(5) - - - - - - - group175
group176 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group176
group178 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 8(6) - 2(1) 5(4) 5(5) - - - - - - - group178
group179 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) 2(2) - - - - - - - - group179
group181 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 3(1) 7(5) 1(1) - - - - - - - group181
group184 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 1(1) 1(1) 1(1) - - - - - - - group184
group185 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4(4) - 1(1) 2(2) - - - - - - - - group185
group186 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 8(6) - - 3(3) 5(5) - - - - - - - group186
group189 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - - 8(7) 4(3) - - - - - - - group189
group19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group19
group191 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 1(1) 1(1) - - - - - - - - group191
group21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 7(7) - 5(2) 11(4) 3(3) - - - - - - - group21
group23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4(3) - 2(1) 5(3) 2(2) - - - - - - - group23
group25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4(4) - - 3(3) 3(3) - - - - - - - group25
group27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5(3) - 2(1) 16(9) 5(3) - - - - - - - group27
group29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 1(1) 4(3) 1(1) - - - - - - - group29
group30 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 4(4) 1(1) - - - - - - - group30
group31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 3(1) 3(1) - - - - - - - - group31
group32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 6(1) 10(4) 1(1) - - - - - - - group32
group40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6(5) - 9(1) 11(2) 2(2) - - - - - - - group40
group42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4(4) - 3(1) 8(3) 3(2) - - - - - - - group42
group43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 11(10) - 5(2) 13(6) 5(4) - - - - - - - group43
group46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - - - - - - - - - - - group46
group48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 2(1) 2(2) 1(1) - - - - - - - group48
group49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 3(1) 4(1) 1(1) - - - - - - - group49
group5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5(5) - 11(1) 14(3) 1(1) - - - - - - - group5
group53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5(3) - 5(1) 14(6) 3(2) - - - - - - - group53
group54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 8(8) - 11(1) 14(4) 2(2) - - - - - - - group54
group55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group55
group56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 6(1) 9(3) 1(1) - - - - - - - group56
group57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group57
group58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - - 4(4) 1(1) - - - - - - - group58
group59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6(6) - 10(1) 10(1) 1(1) - - - - - - - group59
group65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 4(1) 4(1) - - - - - - - - group65
group66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3(3) - 4(1) 12(6) 2(2) - - - - - - - group66
group67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 11(8) - 12(1) 21(7) 2(2) - - - - - - - group67
group68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2(2) - 4(1) 8(4) 1(1) - - - - - - - group68
group69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 9(9) - 11(1) 13(3) 3(3) - - - - - - - group69
group7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 17(14) - 9(2) 18(8) 6(6) - - - - - - - group7
group70 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - group70
group71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1(1) - 2(1) 2(1) - - - - - - - - group71
group72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4(4) - 2(1) 4(2) 2(2) - - - - - - - group72
group8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 11(8) - 1(1) 10(7) 5(5) - - - - - - - group8
group81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4(4) - 3(1) 3(1) 1(1) - - - - - - - group81
group82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 9(3) - 2(1) 19(6) 7(3) - - - - - - - group82
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